Rozpory spojená s CSTO boli prinesené k svetlu v decembri, keď sa členské štáty - Arménsko, Bielorusko, Kazachstan, Kirgizsko, Rusko a Tadžikistan - nedokázali dohodnúť na generálneho tajomníka, aby nahradiť Rusko Úradujúci Nikolay Bordyuzha. Pozícia bola nastavená na otáčať arménskeho kandidáta, ale toto bolo odložené až do apríla, kedy prezidenti Kazachstanom a Bieloruskom nepreukázala do októbra organizácie a december 2016 summitoch respektíve bráni zhromaždenie od dosiahnutia kvórum.
Tento pridal k podozreniu, že Bielorusko a Kazachstan priority špeciálne vzťahy s Azerbajdžanom cez ich viacmenej formálne spojenectvo s Arménskom. Jerevan bol frustrovaný v posledných rokoch s CSTO spojencami predaja zbraní jeho konkurent (a nečlenských), rovnako ako nedostatok reakcia na vojenských incidentov pozdĺž Arménsko, Azerbajdžan hranicu.
Tieto podozrenia bola ďalej priživujú po hlásené vojenskej invázii na 29 decembra. Kým Arménsko a Azerbajdžan vzájomne obviňovali druhej za incident, telo azerbajdžanského vojaka vyvolané na území Arménska podporuje tvrdenie azerbajdžanského vpád do arménskeho krajine. Odstupujúci ruský generálny tajomník Zdalo sa, že stranu s Arménskom, odsudzovať incident ako "provokáciu". Ale zostúpil dní neskôr, a tvrdenie nebolo odozvu u ostatných členov CSTO.
Pri všetkých budúcich strety medzi arménskymi a azerbajdžanskými síl, arménsky generálny tajomník by sa dalo očakávať, aby prijali viac nekompromisný postoj. To je niečo, Bielorusko, Kazachstan a Rusko dokonca bojí - nehovoriac o Azerbajdžane.
Ale iróniou je, že zatiaľ čo CSTO sa snažia vyhnúť zapojiť sa do konfliktu arménsko-azerbajdžanského, jej disfunkčnosť možno ešte pretiahnuť do prebiehajúcej Náhorný Karabach spor. Hoci, že spor nespadá CSTO v kompetencii, jej neschopnosť pôsobiť ako odstrašujúci prostriedok proti opakujúce sa násilia spolu Arménsko, Azerbajdžan hranicu pridáva k negatívnej dynamiku okolo konfliktu a zvyšuje celkovú neistotu regiónu. Okrem toho existuje vysoké riziko, že eskalácia medzi Azerbajdžanom a Náhorný Karabach mohla preliať do Arménska, vyzývajúce k reakcii CSTO.
Okrem toho, ruské pokusy umiestniť CSTO ako protiváhu NATO môže ďalej antagonizovať Arménsko. V krajine sa snaží udržiavať v rovnováhe vlastnej obrannej väzby medzi oboma blokmi, a je jediný člen CSTO prispieva k mierovým operáciám NATO. Boli vzťahy medzi oboma blokmi sa dostať otvorene konfrontačný, že by bolo skutočnou výzvou pre Jerevan manévrovať medzi týmito dvoma.
Pravdou je, že CSTO je ceremoniálne zložka arménskych-ruskej bilaterálnych vzťahov; to je vojenská aliancia s Ruskom, ktoré má počítať pre bezpečnosť Arménska. To vyvoláva otázku, či politické, finančné a ľudský kapitál Arménsko investovala do CSTO stojí za cenu toho, že uviazol v takom nefunkčné a neefektívne vojenského bloku. V záujme seba a regiónu, prehodnotiť v obrannej politiky môžu byť v poriadku.
